リハビリテーション科の治療は、単に病気や外傷を治すだけではなく、運動機能を元に回復させる、或いはできるだけ元に近い状態に回復させることを目的とします。
治療には、大別して手術療法と手術しない保存的療法があります。手術療法には、神経や腱の手術、骨や関節の手術（骨接合術や人工関節置換術）など様々なものがあり、またひとつの疾患や外傷に対する手術法にも色々なものがあります。
例えば、外反母趾やアキレス腱断裂に対する手術です。保存的治療も、薬物療法、ギプスや装具を用いた治療、或いは色々な物療機器を用いた理学療法など、多岐にわたっています。